陕西省商洛市商州区南秦水库行政区划上隶属于商州区，商州区隶属于南秦水库，南秦水库隶属于商洛市，陕西省商洛市商州区南秦水库的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于商洛市。